Các trục trặc về phông chữ có lẽ là "chịu trách nhiệm" về các báo cáo lỗi của GIMP 2 nhiều hơn bất kỳ các nguyên nhân nào khác, mặc dù chúng trở nên ít gặp hơn rất nhiều trong các bản phát hành gần đây của dòng 2.0. Trong hầu hết các trường hợp, nguyên nhân gây ra lỗi là do các tập tin phông chữ xây dựng kém (malformed) gây khó khăn cho Fontconfig. Nếu bạn bị "sập" lúc khởi động khi GIMP quét các thư mục phông chữ của bạn, giải pháp tốt nhất là cập nhật Fontconfig lên phiên bản mới hơn 2.2.0. Giải pháp tạm thời (workaround) là bạn có thể khởi động GIMP với tùy chọn dòng lệnh --no-fonts, tuy nhiên như vậy bạn sẽ không thể sử dụng công cụ gõ chữ.

Một trục trặc khác được ghi nhận là Pango 1.2 không thể nạp những phông chữ nào không cung cấp bản đồ ký tự Unicode. (Pango là thư mục trình bày chữ được GIMP sử dụng). Nhiều phông chữ biểu tượng (symbol font) thuộc nhóm này. Trên một số hệ thống, sử dụng phông chữ như vậy có thể khiến cho GIMP "sập". Cập nhật lên bản Pango 1.4 sẽ giải quyết trục trặc này và khiến cho GIMP dùng được các font biểu tượng.

Một nguyên nhân thường xuyên gây nhầm lẫn xảy ra trên các hệ thống Windows, khi GIMP gặp phải một tập tin phông chữ xây dựng kém và sinh ra một thông báo lỗi: điều này khiến cho một cửa sổ console của Window mở ra và hiển thị một thông báo lỗi: Do not close that console window. It is harmless, and closing it will shut down GIMP. (Xin đừng đóng cửa sổ console này. Nó vô hại và đóng nó lại sẽ khiến GIMP cũng đóng). Khi điều này xảy ra, đối với người dùng nó có vẻ như GIMP đã bị "sập". Thật không may, tình trạng phiền toái này là do một tương tác giữa Windows và các thư viện mà GIMP liên kết vào: nó không thể được sửa chữa từ trong GIMP. Nếu điều này xảy ra, tất cả những điều bạn cần làm là thu nhỏ cửa sổ console lại và quên nó đi.